儿童百日咳主要由百日咳杆菌引起的急性呼吸道传染性疾病，因此孩子得了百日咳以后需要对其进行隔离，要注意保持室内空气的流畅。温度要适宜。避免诱发患儿发生痉挛性咳嗽。
药物治疗首选大环内酯类抗生素如红霉素或者阿奇霉素。病情严重时也可需要加用其他抗生素，但此时不能缩短百日咳的临床过程。痰液粘稠时需要加强呼吸道的管理，雾化吸入稀释痰液，以促进其排出。在夜间，必要时需要给予镇静剂以减少患儿因恐惧、焦虑诱发的痉挛性咳嗽，保证其睡眠。
