早期可无明显症状，随着疾病的进一步发展，可有结核全身症状，低热，乏力，盗汗等。
胃结核，因胃部有溃疡损伤，患者表现为上腹部疼痛，反酸，嗳气，呕吐胃内容物或有咖啡色样液体。胃结核，还可导致患者出现幽门梗阻，肠结核患者可出现腹痛。腹痛部位多为右下腹或脐周，与饮食睡眠无关，可伴有腹胀，若发生肠梗阻或穿孔时，腹痛可突然加重，腹部肿块多为右下腹，有轻微的压痛，还可伴有大便习惯的改变，如腹泻与便秘交替发生，部分患者大便可出现带血。
