谷氨酰转肽酶偏低，可能是由于原发性或转移性肝癌或者是阻塞性的黄疸引起。
转移性肝癌是由全身各脏器的癌肿转移至肝脏形成，血流量异常丰富，全身各脏器的恶性肿瘤大都可以转至肝脏，当病情不稳定时，就会致使谷氨酰转肽酶偏低。其次，阻塞性黄疸是由于肝外胆管，或者是肝内胆管阻塞所导致的黄疸，阻塞性黄疸，尤其是恶性的梗阻性黄疸，多见皮肤瘙痒，而肝细胞性则较少见。肝外阻塞性黄疸较深，体检时，可发现肝脏肿大，也可以引起谷氨酰转肽酶偏低。
