佐匹克隆的副反应，一般与计量及患者的敏感性有关，偶尔可见嗜睡、口苦、口干、肌无力、遗忘，有些人出现异常的容易惊恐、好斗、易受刺激或精神错乱、头痛、乏力、长期服药后突然停药会出现戒断症状。
因为药物的半衰期比较短，而且这种戒断症状出现的比较快。有的可能有较轻的激动、焦虑、肌肉疼痛、震颤、反跳性失眠及恶梦、恶心、呕吐，罕见的比较重的不良反应有痉挛、肌肉颤抖、神智模糊，往往都是继发于较轻的症状。
