肺炎衣原体患者有一些症状，一般它的潜伏期比较久，一般最初有咽喉部的肿痛，有声音嘶哑，可伴有鼻塞、打喷嚏、流鼻涕、头痛，再经过一到四周左右会出现发热，然后干性咳嗽为主，患者往往会出现有不同程度的呼吸加快、咳嗽加重的症状，而且整个病程非常长，尤其是咳嗽的症状会延续持续一到两个月左右的时间。
患者往往会伴随有其他的一些不舒服的症状，比如鼻窦炎引起的鼻腔瘙痒或者鼻腔疼痛，有头晕、头痛，而且患者还少数伴随有咯血的症状出现。
