肛门镜可以查出肛门以及直肠中下段的相关疾病，常见的比如痔疮、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、直肠中下段的肿物等等都是可以通过肛门镜来发现的。
首先会进行肛门指诊进行触摸，再配合肛门镜对直肠内粘膜的颜色以及相关性状进行观察，这样就可以初步明确肛门以及直肠中下段的相关病变了。必要时还要结合肛门腔内彩超、电子结肠镜、肛管压力测定等相关方式来确定其他疾病。
