跑步后出现膝盖两侧疼痛,一般是以下两个原因。1、膝关节滑膜炎。剧烈或者长时间运动,会引起膝关节滑膜肿胀、炎性改变,从而引起膝关节内外侧滑膜受压,向内外侧间隙突出,而产生膝盖疼痛。2、膝关节半月板损伤。跑步运动过量能够使膝关节半月板出现磨损,从而引起膝盖内外侧间隙疼痛。