肛门部有粘液分为肛门部病因和肠道病因两种：肛门部病因常见为痔疮、肛瘘等。有痔疮时，特别是同时伴有肛门括约肌松弛时，一些粘液会溢出肛门外。而肛瘘最主要的表现就是肛门外会有间断性的脓血粘液分泌物。而肠道的原因，最常见于肠炎，特别是克罗恩或者溃疡性结肠炎等等。
最终明确诊断需要去医院首先进行肛门指诊，看看是否有肛门部良性疾病。此外，还要进行肠镜检查，肠镜可以对直肠和整个结肠进行检查，明确诊断后就可以进行相应的治疗了。
