如果在清肠的时候有肛门疼痛的症状，这种情况一般是正常的。因为灌肠大便次数会增多，也会导致肛门疼痛的，这种情况是可以做肠镜的。
虽然做肠镜的时候会刺激到肛门，但是这种程度的疼痛一般不会影响的做肠镜。做肠镜的时间一般十分钟左右。所以，即便肛门有疼痛不适，但是一般都是可以耐受的。如果疼痛的剧烈难忍，最好先让医生检查一下肛门是否有肛周脓肿、肛裂等情况。如果这样的话，也可以择期在进行肠镜检查。
