支原体咳嗽和病毒咳嗽根本的区别是病原体不同,支原体咳嗽为支原体引起,而病毒咳嗽是由病毒引起。支原体咳嗽临床咳嗽比较明显,多为发作性干咳夜间为重,也可产生脓性痰,持久的阵发性的剧烈咳嗽为支原体咳嗽较为典型的临床表现。而病毒性咳嗽,常在急性流感症状尚未消退时出现伴有少量痰或者白色黏液性痰。