两者都属于颅裂畸形的一种，二者膨出的内容不一样。
脑膨出主要是脑组织从颅骨缺损口向外膨出，膨出的内容物主要是脑组织。轻度的脑膨出可以不引起任何临床症状，重度的脑膨出可以与发生部位以及神经系统受损程度呈一定的相关性。脑膜脑膨出主要是脑组织连同其被覆的硬脑膜经颅骨缺损处膨出颅外。同样，轻度的脑膜脑膨出也不会引起明显的系统表现，重度的则有可能会出现智力下降、癫痫，严重的甚至造成瘫痪等神经系统功能障碍。
