自身免疫全套检查主要包括抗核抗体，抗ENA抗体谱。
还有抗中性粒细胞胞浆抗体、抗磷脂抗体、抗环瓜氨酸肽抗体、类风湿因子以及抗平滑肌抗体、抗线粒体抗体、抗乙酰胆碱抗体、抗骨骼肌抗体等。抗核抗体谱中常用的有抗双链DNA抗体。抗双链DNA抗体，是系统性红斑狼疮患者的特征性标志抗体，该抗体阳性为系统性红斑狼疮的重要诊断标准之一。抗双链DNA抗体效价与疾病的活动程度有相关性，抗体效价的动态测定为监控治疗提供了有效的实验室手段。
