肺部需要手术的疾病种类很多，常见的主要包括肺部结节的切除、肺部占位的切除、胸腔闭式引流、胸腔积液引流、气胸引流、肋骨骨折外伤。
还有一些肺部先天性病变，如肺隔离症的手术治疗，支气管扩张时，药物治疗效果欠佳，反复咳嗽，咳痰伴有大量咯血时，病灶局限时，也需要考虑手术切除。
其他如肺囊肿、脓肿、脓胸等，有时也需要考虑手术治疗。
若是真菌感染引起曲菌球，抗感染治疗效果欠佳时，也需要考虑手术切除。
