可以用相关的标本去做真菌的涂片、真菌的培养，还可以用相关的标本去做真菌的病理学检查，以寻找病原体。同时还可以做二代测序查核酸，看看是否有真菌的感染。同时还可以查G试验，GM试验，以及隐球菌乳胶凝集试验，检测是否有真菌感染的可能性。
真菌感染通常还要考虑是否有宿主因素，通常真菌感染发生在免疫力低下的病人当中，相对来说比较常见。如果有真菌感染了，则要积极的给予抗真菌的药物治疗。
