功能紊乱的患者治疗方面，主要在于对症处理。出现腹胀症状可以选择助消化药物。出现便秘症状可以选择泻药，出现腹泻症状可以选择止泻药物。同时也需要积极的抗焦虑治疗。因为功能紊乱的患者，多多少少都是伴有焦虑的。必要的时候可以做一下心理方面的测试。平时要多注意保持健康的饮食和生活习惯，避免胃肠道不适症状的反复发作。饮食以清淡的食物为主，少吃辛辣刺激的食物，多锻炼身体，增强体质。
