百日咳的咳嗽特点主要表现为阵发性痉挛性咳嗽，且伴有“鸡鸣”样吸气样吼声。
病程可分为三个阶段，卡他期、痉咳期和恢复期。
卡他期：表现为轻微的咳嗽。
痉咳期：病情进展，咳嗽加重，有明显的阵发性痉挛性咳嗽。痉咳期特点为成串的、接连不断的，痉挛性咳嗽后伴一次深长吸气。夜间咳嗽更严重，且咳嗽的频率及严重程度会逐渐增加。
恢复期：咳嗽频率和严重程度逐渐减轻，进入恢复阶段。
